برای Hikari Tsutsui، زندگی در قلمرو دو بعدی بسیار ساده تر است. او از نظر اجتماعی ناتوان و بی دست و پا، خود را در بازی های ویدیویی و انیمه غوطه ور می کند، اما بی وقفه توسط همکلاسی هایش مورد تمسخر و طرد شدن قرار می گیرد. شریک بدبختی او یوتو ایتو، تنها دوستش است که گوش گربه ای می پوشد و به همان اندازه شیفته دنیای بازی است. پس از اینکه تسوتسویی مجبور می شود به عنوان تنبیه دیر رسیدن استخر را تمیز کند، با ایروها ایگاراشی ملاقات می کند، اما او سعی می کند از او دوری کند، زیرا بدنامی او پیش از او است. تسوتسویی بی‌رحمانه، مورد نفرت همکلاسی‌های زن، و بدنام به سر و کله زدن با پسرها، معتقد است که درگیر شدن با او چیزی جز مشکلات ایجاد نمی‌کند. کانجو سه بعدی: دختر واقعی داستانی است که حول محور این دو طرد شده می چرخد: پسری پر از احساساتی که قبلاً هرگز تجربه نکرده است و تلاش می کند آنها را آشکار کند و دختری که تلاش می کند او را از پوسته اش بیرون بیاورد.